工资3000罚款1000合法吗

公司罚款1000元不合法。依据《行政处罚法》等，公司无罚款权。不及时处理，可能导致员工权益受损，公司面临法律风险。
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公司不能罚款，但可要求赔偿损失。选择处理方式时，应根据劳动合同约定及员工过错程度，合理确定赔偿金额，并遵守法律法规。
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公司罚款不合法。处理如下：1. 若员工造成损失，按劳动合同约定赔偿，扣除金额不超过最低工资；2. 如无合同依据，公司无权罚款，员工可拒绝；3. 若被非法罚款，员工可向劳动监察部门投诉，维护自身权益。